Fundada oficialmente el 3 de marzo de 1902 con Federico Altamirano como su primer alcalde, Pitrufquén consolidó su crecimiento gracias a su potencial agrícola y a una rica mixtura multicultural de colonos europeos, destacando sectores como Faja Maisan.
Este auge fue impulsado por hitos clave de conectividad en 1898: la llegada del ferrocarril y la construcción del puente sobre el río Toltén. En lo administrativo, la comuna llegó a ser capital del Departamento de Villarrica en 1910 y cabecera de su propio departamento entre 1937 y 1970.
A lo largo de su historia, diversos líderes han contribuido al bienestar de la comuna ocupando el cargo de alcalde:
Fernando Lobos Torres: 1935 – 1944 (tres periodos consecutivos).
Emilio Bornand Dumont: 1944 – 1945.
Luis Brito Aroca: 1945 – 1946.
Ramón Gibert Falcón: 1946 – 1950.
Eugenio Chesta Chateau: 1950 – 1951.
Hernán Cortés Cares: 1951 – 1953.
Eutalio Cicarelli Fuentes: 1953 – 1956 y 1963 – 1967.
Joel Salvo Fredericksen: 1956 – 1960.